Подготовка к реформированию компании началась в мае 2002г. Результатом работы в 2002г. явились:

- реорганизация ремонтной деятельности на станциях ОАО «Новосибирскэнерго», в результате чего весь комплекс ремонтных работ на оборудовании, зданиях и сооружениях станций передан в созданные ЗАО «ПРП» и ЗАО «НЭСР»;

- выведение рентабельной непрофильной деятельности по строительству жилых и офисных зданий на территории г. Новосибирска в ЗАО «Строитель»;

- реорганизация системы материально-технического снабжения путем выделения из состава Общества ЗАО «НЭСКО».

Период с января по июнь 2003г. охарактеризован следующими мероприятиями по реорганизации Общества:

- реорганизация автотранспортной деятельности Общества путем создания ЗАО «АТП» на базе филиала «АТП»;

- окончание 2 этапа реформирования ремонтной деятельности на генерирующих предприятиях: передача функций по техническому обслуживанию зданий и сооружений предприятий энергосистемы в ЗАО «НЭСР» и передача выполнения всех видов ремонтных работ на электростанциях Общества в ЗАО «ПРП»;

- реорганизация ремонтной деятельности сетевых предприятий Общества, в результате чего в созданное ЗАО «Энергоспецмонтаж» передано около 30% объема работ по капитальному ремонту, реконструкции и тех. перевооружению линий электропередач и подстанций;

- создание ЗАО «Инженерный центр» с целью снижения затрат на ремонты путем диагностики оборудования станций и сетевых предприятий.

Дальнейшие структурные изменения ОАО «Новосибирскэнерго» в период с августа по декабрь 2003г. проводились в соответствии с Проектом реформирования, утвержденным Советом директоров Общества 25 июля 2003г. Для организации функционирования существующих видов деятельности Общества в соответствии с действующим Федеральным законодательством РФ были проведены следующие структурные преобразования ОАО «Новосибирскэнерго».

С целью централизации управленческих функций при производстве электрической и тепловой энергии создан филиал «Генерация», куда переведен персонал ТЭЦ-2, ТЭЦ-3, ТЭЦ-4, ТЭЦ-5, БТЭЦ. Также создан филиал «Электрические сети», занимающийся транспортом электрической энергии, в который переведен персонал всех электросетевых филиалов.

Создан филиал «Диспетчерское управление», в который переведен персонал подразделения ОАО «Новосибирскэнерго» - диспетчерское управление. Функции филиала заключаются в обеспечении системной надежности.

Создан филиал «Топливо», в который вошли имущественные комплексы цехов топливоподачи станций ОАО «Новосибирскэнерго» - ТЭЦ-2, ТЭЦ-3, ТЭЦ-4, ТЭЦ-5 и БТЭЦ. Данный филиал занимается организацией поставок топлива на станции филиала «Генерация», а также эксплуатацией складов топлива и оборудования цехов топливоподачи.

На данном этапе начато разделение основных видов деятельности. В отдельное юридическое лицо выделена энергосбытовая деятельность Общества. ЗАО «Новосибирскэнергосбыт» является агентом по сбору денежных средств с потребителей энергоресурсов и ориентировано на куплю-продажу энергоресурсов потребителям области.

Для осуществления деятельности по информационному обслуживанию предприятий ОАО «Новосибирскэнерго» создано ЗАО «Информационные технологии и связь».

В результате заключения соглашения с Мэрией г. Новосибирска о создании совместного предприятия на базе филиала «Тепловые сети» ОАО «Новосибирскэнерго» и МУП «Энергия» создано ОАО «Новосибирскгортеплоэнерго», осуществляющее транспорт тепловой энергии до потребителей.

С целью централизации функции по управлению филиалами и вновь созданными дочерними обществами в 2003г. проведена реорганизация аппарата управления Общества.